Phuntsok Nyidron est originaire de Phenpo Lhundrub (Comté de Gachoe, ouest de Lhassa). Elle allait à l'école de son village, mais dût partir en raison de l'absence de facilité d'éducation. Elle quitta le village en 1986 et rejoint le couvent de Mechungri (Comté de Toelung Dechen) pour devenir nonne. Elle apprit la philosophie Bouddhiste et parlait ouvertement des problèmes des Tibétains. Elle demandait la liberté de parole, une plus grande liberté de mouvement. Elle fut arrêtée le 14 octobre 1989 à l'âge de 20 ans, alors qu'elle menait depuis quelques minutes une marche de manifestation dans la région du Barkhor à Lhassa. Cette manifestation eut lieu 3 jours après que la nouvelle du prix Nobel de la Paix attribué au Dalai Lama arriva au Tibet. Phuntsog Nyidrol fut qualifiée de leader de la manifestation dans le quotidien officiel "Tibet Daily" (Chinois: Xizang Ribao, 18 octobre 1989). Elle fut probablement accusée en raison de sa fonction officielle au couvent.
Phuntsog Nyidron a été condamnée à neuf ans d'emprisonnement pour "incitation contre-révolutionnaire". Sa condamnation fut prolongée de 8 ans (17 ans au total) suivant sa participation à des chants et enregistrements à la prison de Drapchi en juin 1993 avec 13 autres nonnes. Le chant des nonnes parle de leur gratitude envers ceux qui ne les ont pas oubliés, des traitements brutaux dont elles souffrent; elles prononcèrent une dédicace à la liberté du Tibet et au Dalaï Lama. Les chansons furent enregistrées sur un magnétophone obtenu en cachette, puis distribuées en secret au Tibet. Condamnée pour propagande contre-révolutionnaire, Phuntsog Nyidron reçut la condamnation cumulative la plus longue des nonnes.
Le prix Reebok des Droits de l'Homme lui fut attribué en 1995.